严复译《原富》脱稿。又开始译《穆勒名学》。
王先谦刻《汉书补注》百卷。
英属印度政府派遣匈牙利人斯坦因博士由印度到新疆天山南路，以和阗为主，从事调查与发掘，于尼雅河下游废址，得魏晋木简数枚，又得佛经写本残卷及奇异印本多种以归。
光绪二十七年辛丑（1901年） 18岁
参加童生之院试，被取录为生员（俗称秀才），入县学。[14]
诗《有感》，收入《遗书》之《左盦诗录》卷二《左盦诗》，诗题下注“辛丑”，知为本年所作；初稿同题，发表于1905年3月25日出版的《国粹学报》第2期，署名刘光汉，收入《左盦诗录》卷四《左盦诗别录》，词句与收入《左盦诗》者有所不同。
本年，清廷在西安发布“变法上谕”，宣称实行“新政”；《辛丑条约》签订。
章太炎赴苏州东吴大学任教，继续宣传革命；为驳斥梁启超《积弱溯源论》，撰《正仇满论》，发表于东京出版的《国民报》上，公开批驳保皇主义。
康有为著成《中庸注》、《春秋笔削微言大义考》和《孟子微》。
梁启超仍办《清议报》，撰《国家思想变迁异同论》、《中国史叙论》、《卢梭学案》等。年底，《清议报》停刊。
王国维与罗振玉主编《教育世界》杂志。
光绪二十八年壬寅（1902年） 19岁
9月4日（农历八月初三），与堂兄师慎赴南京乡试，堂兄师苍送考。夜乘船过江，师苍不幸溺水身亡，年仅29岁。师苍平日“留心文献，劬学嗜古”，“经术辞章，艺无不精”，尤熟于《元秘史》和历代西域舆地，著有《国语注补辑》、《元代帝王世系表》，其丧，“士林识与不识，无不痛惜之”。[15]一说刘师苍是去南京看望正乡试的堂弟，携一仆同行，“在镇江怡和趸船失足堕水死，仆呼救不及”。[16]
此次乡试，是光绪壬寅补行庚子、辛丑恩正并科，亦是中国历史上首次废试八股文，考试内容改为第一场试中国政治史事论五篇，第二场试各国政治艺学策五道，第三场试四书义二篇、五经义一篇。[17]刘师培此番科场顺遂，连战皆捷，最后得中第十三名文魁（举人）。朱卷署号“鲁源”，后未见用。[18]
诗《咏史》二首，收入《遗书》之《左盦诗录》卷二《左盦诗》，诗题下注“壬寅”，知为本年所作。
文《孙犊山春湖饯别图序》，刊于1905年2月23日出版的《国粹学报》第1期，署名刘光汉；收入《遗书》之《左盦外集》卷十七，目录下标“前十年”，系指民元前十年，故知此文作于本年。
本年，慈禧回到北京，仍维持其统治地位。
章太炎与秦力山、孙中山等在日本横滨举行中夏亡国二百四十二年纪念会；返国后译述日本学者岸本能武太《社会学》一书，并删革修订《訄书》，着手编写《中国通史》。
康有为在印度大吉岭完成《论语注》、《大学注》，《大同书》也于此时写成，以后又迭经增改。
梁启超在日本横滨创刊并主编《新民丛报》、《新小说》，发表《新民说》、《饮冰室诗话》、《论小说与群治之关系》等文章，倡新民之义，主“诗界革命”与“小说界革命”。
严复任京师大学堂编译局总纂，始译甄克思《社会通诠》。
孙诒让《周礼政要》刊行。
光绪二十九年癸卯（1903年） 20岁
3月10、11日，发表《仪征刘君师培留别扬州人士书》，刊于《苏报》上。这是其公开发表的第一篇文章。
4月5日至13日，癸卯补行辛丑、壬寅恩正并科会试在河南开封举行（因北京贡院已被八国联军焚毁），是首次废试八股文的会试，考试方式与范围同于上一年的乡试。刘师培在开封参加了这次考试，虽全力以赴，最终却落了第。自此绝意科场。
开封之行，写下数首记游感怀诗词，有《宋故宫》、《东京清明杂感》（二首）、《扫花游·汴堤柳》、《卖花声·登开封城》、《一萼红·徐州怀占》、《菩萨蛮·咏雁》、《怀桂蔚丞先生》（时客汴省）等。其中《宋故宫》诗题下标“癸卯”二字，显为是时之作；余下几首虽未标出年份，但从题目和内容来看，亦当为同时之作。
《宋故宫》，分别收入《遗书》之《左盦诗录》卷一《匪风集》和卷二《左盦诗》，词句有所不同。按《匪风集》1904年便已存在，刘师培在《甲辰年自述诗》中自注曰“予著《匪风集》诗词”，[19]《左盦诗》则编定于庚戌年（1910年），“编左盦诗时，匪风集已被废弃矣”，[20]故《左盦诗》中所收为改定稿。该诗发表于1905年3月20日出版的《政艺通报》乙巳第3号，署名申叔，词句全同于《匪风集》中所收。
《东京清明杂感》（二首），刊于1905年5月23日的《国粹学报》第4期，署名光汉子；收入《遗书》之《左盦诗录》卷四《左盦诗别录》。
《扫花游·汴堤柳》，刊于1905年2月23日出版的《国粹学报》第1期，署名刘光汉；收入《遗书》之《左盦词录》。
《卖花声·登开封城》，刊于1905年6月23日出版的《国粹学报》第5期，署名刘光汉；收入《遗书》之《左盦词录》。
《一萼红·徐州怀古》和《菩萨蛮·咏雁》均刊于1905年3月25日出版的《国粹学报》第2期，署名刘光汉；收入《遗书》之《左盦词录》。
《怀桂蔚丞先生》（时客汴省），收入《遗书》之《左盦诗录》卷一《匪风集》；又以《怀桂蔚丞丈》之名收入《左盦诗录》卷二《左盦诗》，词句稍有不同，当为改定稿。发表于1906年3月9日出版的《政艺通报》丙午第3号，署名光汉，题为《怀桂蔚丞》（时客汴梁），词句全同于《匪风集》中所收。
5月初，从开封回扬州途中滞留上海，“晤章君炳麟及其他爱国学社诸同志，遂赞成革命”。[21]
按刘师培此前在扬州已与种族革命家王郁仁（名钟麒，号无生，别号天僇生）往还，接触过创刊不久的《浙江潮》等反满刊物，并通过王郁仁结识了福建革命志士林獬（字少泉，号白水），故具一定的排满革命思想，所以在上海见到章炳麟（太炎）等人后，很快赞成革命。此时，上海已有倡导教育改革和排满革命的团体中国教育会与爱国学社，前者是由蔡元培、叶瀚、蒋观云等人于1902年4月发起成立的，蔡元培为事务长；后者是在1902年11月南洋公学退学风潮发生后，由蔡元培与中国教育会同仁组织退学学生成立的，蔡任教员。刘师培与上述诸人结识后，迅即加入中国教育会，投身于革命潮流中。
刘师培一向敬仰章太炎，“尤佩仰章太炎学术”。[22]章太炎也素来钦仰仪征刘氏的世代经学，自身又是经学大家，故与颇具经学素养的刘相识后，惺惺相惜，极为投契，引为知己。两人商讨了古文经学研究的各种问题，交换了对古文经学与今文经学关系问题的看法。不久，章太炎因“苏报案”入狱，但虽身陷囹圄，仍两次致书于刘。第一封信以《章太炎致刘申叔书》为题收入1905年2月23日出版的《国粹学报》第1期，钱玄同将其以《与刘光汉书一》之名收入《遗书》，标题下注“民元前九年癸卯”。[23]该信首先关注刘的身体，因知其“忽患失血”（刘师培所患肺病大概肇始于此），嘱其“少自珍惜，游心物外”，接着问及其家传之学，并谈及自己多年从事《春秋左氏传》研究的情形，以“保存国粹”之愿与其共勉。第二封信以《章太炎再与刘申叔书》为题收入《国粹学报》第1期，钱玄同将其以《与刘光汉书二》之名收入《遗书》，标题下注“前九年癸卯”。[24]该信是对刘氏来书的答复，因写信前一天收到刘师培手札并所撰《驳太誓答问》、《小学发微》两文。信中主要内容是讨论《左传》和小学的问题，并给刘氏所撰两文以极高的评价，认为《驳太誓答问》“条理明带遰，足令龚生钳口”，《小学发微》“以文字之繁简，见进化之第次，可谓妙达神指，研精覃思之作矣”。
《驳太誓答问》，发表于1905年3月25日出版的《国粹学报》第2期，作《驳泰誓答问》（未完），署名刘光汉；收入《遗书》之《左盦外集》卷一。
《小学发微》，疑已佚。钱玄同认为《小学发微》与《论小学与社会学之关系》（刊于《警钟日报》1904年11月21日至12月3日）为异题同文，“盖此篇初名《小学发微》，登报时欲求意义明显，故改题为《论小学与社会学之关系》……而内容亦必不尽相同”。[25]实则二者非同文。其证有三：一是刘师培本人非以二者为同文，而是视作独立的两篇文章，如在《周末学术史序》夹注中，他几次分别提及“见旧作《小学发微》”、“见旧作《小学与社会学之关系》”；二是两文宗旨迥然不同，《小学发微》所述之义在于“以文字证明社会进化之理”，《论小学与社会学之关系》则以社会学考中国造字之源；三是从《论小学与社会学之关系》所征引的译著看，该文脱稿的时间不可能早于1904年1月，因其所引用的严复译《社会通诠》一书在1904年1月由商务印书馆首次出版，且其与严复没什么往来，在严译正式出版前读到其手稿的可能性微乎其微。而《小学发微》则是1903年的作品。[26]
本月，作《包慎伯说储跋》，是为家藏包世臣《说储》一书所作的跋文，文末属“癸卯四月”，故知作于此时。收入《遗书》之《左盦外集》卷十七。