刘锦棠笑着推辞道：“征战这么多年，本将军也疲倦了，真想跟你们去过无拘无束的日子。但老叔刚阵亡，这个仇本将军总要先报了再说。将来要是人会，你们可不要食言。”
就这样聊了大半个晚上，这帮叛军不仅被刘锦棠稳住了，还真拿他当自家兄弟一般。
天亮了，刘锦棠叫来一名亲兵，让他出营传令，让开一条路，准备让要离开的弟兄们走，再催快些把饷银运过来。过了不到一个时辰，四匹马驮着饷银就过来了，白花花的银子在营地上堆着。刘锦棠让两位哥老会首领负责发下去，他们又找了十几个人分头负责发饷，刘锦棠则趁乱出了营。等哥老会的人发现时，为时已晚，两个炮营同时开炮，营内校场上顿时血肉横飞，鬼哭狼嚎。有人想向外冲，也被乱枪打成了马蜂窝。
随后刘锦棠带人人营，指着横七竖八的尸体道：野老统领尸骨未寒，他们就兴兵作乱，本将军岂能饶了他们？哥老会干扰军令，败坏军纪，不杀何以治军？大帅日夜为粮饷操劳，连自己的养廉银都捐出来了，他们却在这大放厥词，说大帅贪墨粮饷，如果本将军放过这样的人，简直是天理难容。以后胆敢有人闹事作乱，这就是下场。”
“古牧地贼众诈降害死老统领，我大军概不受降！本将军要用他们的血来祭老统领的亡魂！”他拿着马鞭指着古牧地方向，接着又命令亲兵把那些散落在尸体中间沾满血腥的银子捡了起来，并吩咐这些银子要赏给那些上阵杀敌的真勇士。
刘锦棠和金顺的部队把古牧地团团围住，并在城外修起了十几座炮台，居高临下地轰击城墙。很快古牧地的城墙就被轰开了两个缺口，官军号角齐鸣，士气大振，攻了进去。阿斯图眼见无力抵抗，只好打白旗投降。刘锦棠让敌军互相指认，统兵五十人以上的头领全部押到刘松山阵亡之处，一声令下，这些人全部被当场斩首。阿斯图的脑袋也被挂在军旗上，在各营传看。
在阿斯图的房间内，刘锦棠搜到了一封信，从信中得知，古牧地驻扎的都是敌军的精锐，乌鲁木齐其实十分空虚。
刘锦棠和金顺决定一鼓作气，乘胜进军。次日半夜他们就率大军向乌鲁木齐进发，天亮时就兵临城下。据守乌鲁木齐的敌将早已闻风丧胆，于前一天带着随从、女人和珠宝南逃了，守军更没料到官军会来得这样快，立即弃城而逃。官军几乎兵不血刃，就收复了乌鲁木齐。
据守天山北路的昌吉、呼图壁和玛纳斯敌军，听到古牧地、乌鲁木齐被官军占领的消息，便知道大势已去，纷纷逃走了。
北疆基本肃清的捷报传到京师，慈禧十分高兴道：“真没想到，仗打了不到三个月，北疆就基本收复了。当初俄国人说收复了乌鲁木齐、玛纳斯等城就交还伊犁，现在金顺已任伊犁将军，就让他去和俄国人交涉，刘锦棠继续南下，收复南疆。”
左宗棠收到上谕，立即回奏朝廷，说现在不是向俄国人索还伊犁的时候，也不是收复南疆之时。他指出现在官军还有后顾之忧，俄国人必然会提出苛刻的交还条件。如果我们答应，肯定吃亏不小。如果不答应，俄国人肯定要以武力相威胁。一旦俄国与阿古柏相勾结，官军势必腹背受敌，不但南疆收复无望，就连刚收复的地方也有重新陷敌的可能。所以，必须等收复南疆后，大军一意向北，那时候再索还伊犁，不但理直，而且气壮。
至于南疆，现在也不是收复的时候。向南进军必然要翻越天山，而翻越天山必经达坂城。此城在蒙古语叫阿喇巴尔葛顺，意思是黑虎城，形容地形极为险要。向达坂城东行二百里，就是吐鲁番，向西南行百余里就是托克逊。阿古柏必在三地屯驻重兵，以为掎角之势。
南下必有几场恶战，军粮储备至少要三个月。现在冬天即将来临，冰天雪地，运道已经不通，后勤不能保障，根本无法进军。最关键的是楚军人疆后不少人感染疫病，刘锦棠也病势严重，虽经医治幸免一死，但一时也不能恢复。
慈禧看到回奏后虽心有不甘，但左宗棠说得合情合理，就只好由他去了。
看到左宗棠在新疆又立战功，有人心里就不舒服了，开始在鸡蛋里挑骨头，上奏指责刘锦棠在古牧地杀人太多，说阿斯图已经投降，就应该放一条生路，而且如此重要贼首，应该向朝廷献俘。慈禧不置可否，只让军机处把奏折转抄给左宗棠。
刘锦棠此时已经回到肃州行辕，一则是为了养病，二则是大帅要面授机宜，还有就是他在古牧地擅杀降将一事。左宗棠正为此事恼怒，一见刘锦棠就将他狠狠训斥了一顿。刘锦棠初生牛犊，并不服气院野难道大帅以为这些人不该杀吗？”
“他们既已求抚，你就不能滥杀，不然以后谁敢向官军投诚？”左宗棠瞪大眼睛怒斥道。
刘锦棠并不服气，又道：“不受抚就剿，这有什么好说的？”
左宗棠闻言拍案大怒：“是剿是抚本帅自有斟酌，就是你叔叔，像这样的大事也不敢自专。本帅不与你多费口舌，来呀！把刘锦棠送到刘松山的祠堂里，让他待参吧！”
左宗棠西征行辕里设有西征将士祠堂，凡总兵以上阵亡者，都立有牌位，日日香火不断。刘松山是左宗棠倚为臂膀的悍将，他的灵位摆在十分显眼的位置。
案上除了香炉之外，还摆着一沓信稿，全是刘松山写给左宗棠的，有报告大军行止的，有商讨战略战术的，更多的是对一些具体问题的请示。刘锦棠杀完仇人，只觉得痛快，现在天天看叔叔写的这些信，慢慢也就明白了，像一次斩杀数百人的大事，他岂能独断专行？左宗棠是何许人？他的权威是不容挑战的。
冷静下来后，刘锦棠就开始后悔了，如果左宗棠具折参奏，那一奏一个准，他恐怕只有回家扛锄头了。他统军不到半年，已在军中树立了绝对威信，数万大军指挥自如，驱之如同犬马，正是踌躇满志、立功心切之时，他怎甘心被大帅一纸参奏打发回籍？但他又不甘低头向左宗棠认错，因此焦虑不安，备受煎熬。
其实左宗棠并没有上奏参刘锦棠，但早有人上了密折，上谕令左宗棠详查回奏。有人向刘锦棠密报了这事，他如热锅上的蚂蚁，心想自己顶撞大帅在先，如今又有这份上谕，恐怕自己要与金戈铁马的日子无缘了。他正在懊恼万分，戈什哈突然来请，说大帅要见他。
刘锦棠硬着头皮来到大帐，本以为左宗棠定是怒容满面，没想到进了大帐，左宗棠竟和颜悦色地问道：“你想明白了吗？”
“属下想明白了，贼军已降，不该再杀，这是其一。不请大帅军令，擅自行事，这是其二。属下闭门思过，认为这第二个错比第一个更不可饶恕。如果全军上下人人不请军令各行其是，大军就是一盘散沙。”刘锦棠低垂着头道。
“好，你能这么想，就说明你真想明白了。大军在外群龙无首，我实在放心不下，军中事多，你明天就回去吧。”
刘锦棠闻言惊讶道：“大帅就这么放属下回去？”
“不这么放你回去还想怎样？难道你还让我敲锣打鼓送你回去不成？”左宗棠笑道。
“听说有人密参属下，大帅就这么放属下回去，如何向朝廷交代？”
“实话跟你说，正是这份密奏救了你。”左宗棠把上谕递给刘锦棠，“我的属下要赏要罚，要由我发话，别人饶舌，我偏不罚，绝不能让他们指手画脚。”
“大帅不处罚属下，那如何向朝廷交代？”
左宗棠不以为然道：“朝廷还不好打发？我就说你是遵我军令，斩杀悍匪，就把他们的嘴堵上了。朝廷总不能把我这个督办军务的钦差大臣撤了吧？”
刘锦棠没想到这事就这么过去了，跪倒在地道：“属下从此跟定大帅，赴汤蹈火，在所不辞。”