登陆台湾的日军不适应当地的气候，士兵患痢疾严重，死了好几百人。日军打又打不赢，守又守不住，只得派人到北京谈判。日本人非常急于结束战事，但表面上却不动声色，而且提出了很多过分的要求。当时与日本人谈判的是李鸿章，他怕战事扩大，日本会进攻天津，也急于签订和约。再加上有英美等国帮着日本说话，最后双方签订了《天津专条》，清廷不但赔偿了曰本五十万两银子，还承认日本进军台湾是保民义举。
《天津专条》签订后，总理衙门上奏《海防亟宜切筹武备必求实际疏》，建议加强海防建设。但加强海防要花银子，收复新疆也要花银子，怎么办？朝廷就把总理衙门的奏折发给封疆大吏们讨论。
大家立场不一，意见不同。有人主张一力收复新疆，但也有人主张停止西征，把银子省下来筹办东南海防。李鸿章的折子上得最晚，但是分量最重。
日本进攻台湾，最为紧张的就是他这位直隶总督。两次鸦片战争，洋人都是靠军舰封锁天津海岸，直接威胁京师，迫使朝廷就范。他坐镇直隶，却没有几艘可依赖的军舰，所以一直担心日本人也来这一手。他最希望停止西征，把银子拿来置办军舰。因此，他在奏折中道——
新疆各城，自乾隆年间始归版图，岁需兵费三百余万，徒收数千里之旷地，而增千百年之漏厄，实为不值。且其地北邻俄国，南近英属之印度，即勉图恢复，将来断不能久守。今虽命将帅出师，兵力饷力万不能逮。可否密谕西路各统帅，但严守现有边界，且屯且耕，不必急图进取。新疆不复，于肢体元气无伤；海疆不防，则腹心大患愈棘，孰重孰轻，一目了然，故西征各军，可撤则撤，可停则停，其停撤之饷，即匀作海防之饷。否则只此财力，既备东南万里之海疆，又备新疆万里之饷运，朝廷如何能够支撑？
他的意思再明确不过了，新疆不过是荒寒之地，当年乾隆帝收回就没有多大意义，现在东南沿海紧张，就应该放弃新疆，专顾东南。
军机大臣宝鎏首先支持李鸿章的主张，他是户部尚书，愁的就是银子，用兵陕甘已花了不少银子，再收复新疆，恐怕开销更巨。
文祥却坚决不同意李鸿章的主张，在他看来，祖宗之地不可弃，不然则列强效仿，大清岂不将被瓜分？
恭亲王自然同意李鸿章的主张，而其他几位军机不置可否，唯恭亲王马首是瞻。
“要不先回奏皇上，看皇上怎么说？”恭亲王道。
皇上能怎么说？大主意向来是军机处拿，皇上大多是画诺而已。文祥知道此事皇上一旦同意就无可挽回了，因此恳请恭亲王再容大家仔细想想，明天回奏。这个要求恭亲王不好回绝，毕竟文祥是军机里身份仅次于他的人。
当天晚上，文祥就去了大学士倭仁府上。一路上他在想，倭仁虽然守旧，但他是个忠君爱国的臣子，收复新疆这样的大事，他不会糊涂。只是当年为创办福州船政局的事，他与左宗棠闹得势如水火，如今督办新疆军务的恰是左宗棠，不知他会做如何想。但事情紧急，也由不得文祥瞻前顾后了。
一到倭仁府上，管家便道倭大人身体不好，早休息了。倭仁之子见文祥亲自来访，猜想必有大事，因此请他喝茶稍后，他去叫醒父亲。
“不用叫倭相起身了，我直接去卧房。”文祥说着便直奔卧室而去。
倭仁见文祥进来了，便起身道：“文相，我老了，不中用了。”
文祥连忙道：“倭相这是说哪里话，咱们这个年纪谁没个三病四灾的？皇上刚亲政，正需要您辅佐呢！”
“你看看我这身子骨，哪还能辅佐皇上？有你们这些大臣辅佐，哪有我说话的地方？”倭仁慨然道。
“倭相，有些事离了您还真办不成。我是越想越糊涂了，当年乾隆爷平定准噶尔叛乱，一统新疆，到底是对还是错了呢？花那么多银子收回一块荒芜之地，每年还要花上百万两军费，实在是太得不偿失了！”文祥摇摇头道。
倭仁一听这话脾气就上来了，猛烈咳嗽几声，气喘吁吁道：“你这是什么话？无论荒芜繁华，都是我大清版图，镇守边疆，自然要花银子，那又不是做买卖，谈不上值与不值。何况新疆并非荒芜之地，伊犁一带就被称为塞上江南！”
“倭相的话自然不错，可现在要紧的是东南沿海，朝廷又没那么多银子，不如停止西征，把军费省下来加强海防，新疆就随它去吧。”文祥又激将道。
倭仁气得手直抖，斥责文祥道：“你们军机大臣就是这样辅佐皇上的吗？大军已经云集新疆，就是不再西征，军费也要一直开销。就算省下几个，我看也未必能够加强海防。这是拆西墙补东墙，西墙必塌无疑，东墙却未必能扶得起来！”
文祥起座拱手道：“倭相，实不相瞒，这是李少荃的主意。他坐镇直隶，说的话向来有分量，万一皇上准了他的奏章，新疆恐怕从此易主。我身在军机，有些话不好说，所以特来恳求倭相。”
倭仁一下明白了，连忙道歉道：“文相，我错怪你了。你放心，我明天一早就去求见皇上。”
文祥走后，倭仁不顾病体，连夜起草奏折，第二天一早就去朝房等候。他身体不好，皇上特准他不必早朝。见他来这么早，大家都有些意外，都恭喜他身体康复。他摆了摆手道：“身子还是老样子，如今台湾之事已了，应该令左宗棠进军了，老夫今天是专为此事觐见万岁爷的。”
恭亲王等人听倭仁如此说，都感到有些诧异，所以就把目光转向文祥，文祥却摇了摇头。在一般情况下，头起是见军机大臣，可今天却比平时多等了半个时辰。大家都交换着眼色，或者打着手势，猜测是什么原因。又等一会儿，乾清宫的太监才出来传话道，皇上口谕，昨日偶感风寒，浑身燥热，早朝就免了。诸位大臣各司其职，不必进宫见驾。
不必进宫见驾，就是可以不去问安，大家只好散去。回到军机处，大家就商议着把太医叫来问问皇上的病情再说。一会儿之后，太医院医正李德立就过来了，“给恭亲王及诸位大臣见礼，报告同治脉象院野皇上感了风寒，如果没错，下午定会好转。”
恭亲王呵责道：“你这是什么话，这不是连皇上的病症都还没有确定吗？那你又如何能对症下药？”
李德立平日与恭亲王十分相熟，敢于说话，便道：“世间没有万分确诊的病症，皇上的脉象接近风寒，当然要按风寒用药。臣过一个时辰再人宫请脉，那时再给王爷详细报告。”
一个多时辰后，李德立又来报告，说已经给皇上请过脉了，但热还未退，受风寒的症状已经十分明显了。恭亲王闻言便递牌子请求见驾，一会儿之后，太监便出来请他进去，说两宫皇太后也过来了。
恭亲王进殿后便给两宫和皇上请安，他见皇上面色微红，比平日倒显精神。
“朕昨日到西苑游玩，感了风寒，并无大碍，只是心里燥热，口有些干，六叔就放心吧！”
可到了第二天，同治依然不能上朝，到了下午，体热非但没有退，而且身上还出了小疙瘩，太医会诊后认为是天花。于是宫里又立即忙活起来了，大臣、太监、宫女都穿起了花衣，乾清宫里也铺上了猩红的地毯，还请了痘神娘娘。
太医按天花治了二十多天，同治的病势不轻反重。天花一般不过十七八天，同治的迹象越来越不像天花了。而坊间种种传闻，关于皇上逛八大胡同的说法也传进了恭亲王耳里。
皇上逛八大胡同的事情确是真的。因为慈禧干预同治的夫妻生活，他干脆谁也不再宠幸，赌气跟着贝勒载徵经常微服出宫，四处游玩，后来就迷恋上了八大胡同。
恭亲王听了传言大吃一惊，这种事无论外间怎么传也不能从他口中说出，但他又不能不闻不问。他想把载徵叫过来问问，但万一是实情该怎么办呢？打那个不成器的东西一顿吗？那传出去不是更印证了民间传闻？所以一时拿不定主意。后来，他把李德立叫到军机处，把所有的人都打发走了，才低声问道：“野皇上得的真是天花吗？你就实话实说，皇上到底是何症，大约什么时候能上朝？”
李德立沉默了良久，最后才道：野王爷，圣母皇太后懿旨：“李德立，皇上既然是天花，就按天花上心治吧。”