16沮渠蒙逊迁都到姑臧。
17十一月十三日，太尉刘裕抵达江陵，杀郗僧施。当初，毛修之虽然是刘毅僚佐，但一向自结于刘裕，所以刘裕特别赦免他。赐王镇恶为汉寿子。刘裕问刘毅府咨议参军申永说：“现在怎么做才好？”申永说：“化解旧仇，加倍恩惠，依照门第高下依次给予官职，公开擢升有才能的人，如此而已。”刘裕采纳，下书宽免租税，减省差役，放宽刑罚，礼聘名士，荆州人民喜悦。
18诸葛长民骄纵贪侈，所为多有不法，成为百姓祸患，时常畏惧太尉刘裕治他的罪。等到刘毅被诛，诸葛长民对亲信说：“前年醢彭越，今年杀韩信。我大祸将至矣！”于是屏去随从，单独问刘穆之说：“悠悠之言，都说太尉对我不满，何以至此？”刘穆之说：“刘公溯流远征，把老母、稚子都托付给你。如果有一点点不信任，岂能如此呢！”诸葛长民这才稍微安心。
诸葛长民的弟弟、辅国大将军诸葛黎民对他说：“刘毅灭亡，也让诸葛氏恐惧，应该乘刘裕还没回来，图谋大事。”诸葛长民犹豫，未能发动，既而叹息说：“贫贱时总想要富贵，而富贵必埋藏危机。今天想要在丹徒做一个平民，又怎么可能呢！”于是写信给冀州刺史刘敬宣说：“刘毅狠戾专恣，自取夷灭。异端将要除尽，天下正在太平，荣华富贵，我与您共享。”刘敬宣回复说：“下官自义熙年间以来，曾做过三个州的刺史、七个郡的太守，时常惧怕福禄之后，灾变继之而生，常思避免满盈，宁愿吃亏受损。您所说的富贵，我不敢当。”并且把诸葛长民的信送给刘裕，刘裕说：“阿寿（刘敬宣）果然不辜负我。”
刘穆之担忧诸葛长民发动政变，屏去旁人，单独问太尉行参军、东海人何承天说：“刘公此行，能否成功？”何承天说：“荆州之事不必担心，只是有别的忧虑罢了。刘公当年从左里返回石头城（击破卢循返回），非常轻松洒脱，但这次回来，要严加谨慎。”刘穆之说：“不是你，我听不到这样的话。”
刘裕在江陵，辅国将军王诞向刘裕申请说，他先回去。刘裕说：“诸葛长民似乎有自疑之心，你怎么敢随便前往！”王诞说：“诸葛长民知道我蒙受您的垂青，如今我轻身单下，他必定认为没事，可以稍微让他安心而已。”刘裕笑道：“你的勇气超过孟贲、夏育。”于是让他先回。
【华杉讲透】
刘敬宣的话：“常惧福过灾生，思避盈居损。”避盈，是避免满盈，总是比自己该拿的少拿一点。居损，就是保持处于吃亏受损的位置。这样，就能避免“福过灾生”。
这样的话，现在跟诸葛长民说，已经太晚了。早一点跟他说呢，他体会不到，只会对你嗤之以鼻。
两种人，两种价值观，对不到一块儿。话能对上的时候，时间又对不上，没有用。诸葛长民此刻何尝不想避盈居损，他连回到丹徒做一个平民都愿意！但是，他之前的罪行，无法抹去，一定会被清算。所以他现在回不了头了。
那么，他现在应该怎么办呢？只有把自己捆了，到廷尉自首，任由刘裕处置，或许还能得到一个安排。但是，像他这样渴望富贵的人，要他主动放下，他做不到。做不到，还有一个选择，就是该干吗干吗，今朝有酒今朝醉，过得一天是一天，要治我的罪你就治吧！这时候，他又有第二个毛病，侥幸，他还想搏一搏。要搏，就要拼死一搏，他的第三个毛病又来了，他没勇气拼，他只能到处试探商量，搞到全国人民都知道他要叛变了，他却还没行动，于是他只能在纠结焦虑中熬到死亡解脱。
过去的罪行现在的病，诸葛长民的事，无解。
沮渠蒙逊即河西王位
19沮渠蒙逊即河西王位，大赦，改年号为玄始，设置官僚，与后凉王吕光当年称三河王时规制一样。
刘裕伐蜀
20太尉刘裕准备伐蜀，选择元帅，找不到合适的人。认为西阳太守朱龄石既有军事才干，又熟悉地方事务，想要用他。众人都认为朱龄石资历尚轻，名望不够，难当重任，刘裕不听。十二月，任命朱龄石为益州刺史，率宁朔将军臧熹、河间太守蒯恩、下邳太守刘钟等伐蜀，分大军一半二万人配给他。臧熹，是刘裕的妻弟，官位本来比朱龄石高，也做他的下属。
刘裕与朱龄石密谋进取，说：“刘敬宣往年从黄虎进兵，无功而退。贼人认为我军这次会从岷江前往，既而认为我军会出其不意，兵出涪水。如此，必以重兵守涪城以备涪水。如果我军走黄虎，正好自投罗网。如今，我们以大军从岷江直取成都，疑兵出涪水，这是制敌之奇计。”之后，担心这项秘密计划泄露，被贼人知道了虚实。另外密封一封信交给朱龄石，信封上写着：“到白帝城再打开。”诸军虽然前进，但是谁也不知道行军路线。
毛修之坚决要求参与伐蜀行动，刘裕担心毛修之与蜀人有血海深仇，他去了，必定多所诛杀，而土人与毛氏有仇，也会拼死固守，不许他去。
21晋国分割荆州十郡，设置湘州。
22加授太尉刘裕为太傅、扬州牧。
23十二月二十一日，北魏主拓跋嗣北巡，至长城而还。
义熙九年（公元413年）
1春，二月十五日，北魏主拓跋嗣抵达高柳川。二月十九日，还宫。
2太尉刘裕从江陵东还，陆续运送辎重兼行而下，每到该抵达的日期，就滞留不进。诸葛长民与公卿每每在新亭迎接，总是没有接到。二月三十日，刘裕轻舟径进，秘密入城，进入东府。三月一日早上，诸葛长民听说刘裕已经到了，大惊，直奔上门。刘裕命壮士丁旿埋伏于帐幔中，待诸葛长民进去，屏去他人，与他闲谈，平时聊不到的话题都聊到了，诸葛长民非常喜悦。这时，丁旿从帐幔后出来，就在座位上将诸葛长民拉住并刺杀，把尸体送到廷尉。又逮捕诸葛长民的弟弟诸葛黎民，诸葛黎民一向骁勇，格斗而死；并杀其三弟、大司马参军诸葛幼民及堂弟、宁朔将军诸葛秀之。
3三月五日，后秦王姚兴遣使到北魏修好。
4太尉刘裕上表说：“大司马桓温认为：‘人民没有安定的故土，是对治理最大的伤害’，《庚戌》土断，以现居地为他们的户籍所在地，让他们安居乐业。于是财足国丰，根本原因在此。从那时候到现在，这项制度又渐渐废弛了，因此请重申前制。”于是依界土断，唯独徐州、兖州、青州三州居于晋陵者，不在土断之列，其他各流寓郡县，多所合并、减省。
【华杉讲透】
桓温的话，“民无定本，伤治为深”，根本不定，则不仅伤害国家的治理，也伤害人民自己成家立业。晋朝人民是从北方南迁，开始时认为自己只是“暂住”，还随时准备回到北方家乡去，籍贯也还登记当年在北方居住的郡县，过了几代人，还是这样。桓温推行“土断”政策，就是以现居地为户籍所在地，让大家安居乐业。刘裕说，“财阜国丰，实由于此”，这是之后居民和国库财富增长的关键。孟子说：“有恒产者有恒心。”东晋的情况，人民不仅没有恒产，脚下的土地都是“暂住”，那恐怕种棵树他都不愿意，怎么能安居乐业，还为子孙规划建设？所以，土断政策，是当务之急。
5三月十三日，加授刘裕为豫州刺史。刘裕坚决辞让太傅、州牧职位。
6林邑范胡达入寇九真，杜慧度击斩范胡达。
7河南王乞伏炽磐派镇东将军乞伏昙达、平东将军王松寿将兵东击休官权小郎、吕破胡于白石川，大破之，掳掠其男女一万余口，进据白石城。显亲休官权小成、吕奴迦等二万余户占据白阬，不服，乞伏昙达进攻，将他们斩首，陇右休官全部投降。后秦太尉索稜献出陇西，投降乞伏炽磐，乞伏炽磐任命索稜为太傅。
夏王刘勃勃建统万城，改姓赫连
8夏王刘勃勃大赦，改年号为凤翔。任命叱干阿利兼领将作大匠，征发岭北夷人、夏人十万人筑都城于朔方水北、黑水之南。刘勃勃说：“朕正要统一天下，君临万邦，新城应该命名为统万城。”叱干阿利性格巧诈而残忍，蒸土筑城，他拿一个铁锥去检查工程质量，如果铁锥能刺入城墙一寸，即刻杀死负责该段工程的人，重建。刘勃勃认为这是他的忠心表现，委任给他。凡是兵器造成，交给他验收，一定会有工匠被处死，用弓箭去射盔甲，如果射不穿，就斩制造弓箭的人，如果射穿了，就斩制作盔甲的人。又用铜铸一面大鼓。还有飞廉、翁仲、铜驼、龙虎等，以黄金装饰，列于宫殿之前。前后杀了工匠数千人，由是器物都非常精利。
刘勃勃自认为他的祖上跟从母姓为刘，不合礼制。古人选取姓氏，并没有一定之规，有的以居住地为姓氏，有的跟父亲姓，有的跟母亲姓，刘勃勃自己改姓为赫连氏，说帝王是天的儿子，其美好而显赫，与天相连。这个姓氏，只能是正统子孙才能采用，其他旁支庶子，以铁伐为姓氏，寓意其刚锐如铁，能砍人伐人。
【华杉讲透】
赫连勃勃至此出世，意思是显赫得与上天相连的刘勃勃。
9夏，四月二十一日，北魏主拓跋嗣西巡，命郑兵将军奚斤、鸿飞将军尉古真、都将闾大肥等攻击越勤部于跋那山。闾大肥，是柔然人。
10河南王乞伏炽磐派安北将军乌地延、冠军将军翟绍攻击吐谷浑别统句旁于泣勤川，大破之。
11河西王沮渠蒙逊立儿子沮渠政德为世子，加授镇卫大将军、录尚书事。
12南凉王秃发傉檀讨伐河西王沮渠蒙逊，沮渠蒙逊在若厚坞击败秃发傉檀，又在若凉再次击败他；于是进军包围乐都，二十天不能攻克。南凉湟河太守文支献出本郡，投降沮渠蒙逊，沮渠蒙逊任命文支为广武太守。沮渠蒙逊又讨伐南凉，秃发傉檀以太尉秃发俱延为人质求和，沮渠蒙逊退兵。