拓跋嗣与群臣商议说：“胡人叛乱，已超过一年，讨之不克，而其众繁多，为患日深。如今已是深秋，不可能再发兵，因为会耽误农时，怎么办？”白马侯崔宏说：“胡人虽多，并无健将统御，终究不能成为大患。公孙表等诸军，并不是兵力不足，而是法令不整，战略战术错误，所以致败。如果能派一位有威望的大将，率数百骑兵前往，接管公孙表军，必定战无不克。相州刺史叔孙建之前曾任并州刺史，胡人、北魏都畏服他，诸将莫及，可以派他去。”拓跋嗣听从，任命叔孙建为中领军，公孙表等都由他节制，讨伐刘虎。九月戊午（九月无此日），大破叛军，斩首一万余级，刘虎及司马顺宰都被杀死，俘虏其部众十万余人。
【华杉讲透】
决定成败的是人，不是战略
很多时候就是这样，千战略，万战术，商量来商量去，其实都没有用，因为成败的真因，和战略战术一点关系也没有，是派去的人不行，换一个人就解决了，不用开会讨论新战略。派去的人怎么不行呢？从历史经验上看，有两种不行，一是公孙表这种，军事能力不行；另外一种，派去当地的官员，本身就是叛乱的原因，正是他的残暴统治，激起了当地人民的反抗，换一个“好官”，马上就招抚平定了，不用打仗。
刘裕灭后秦
18太尉刘裕到了彭城，加领徐州刺史；任命太原人王玄谟为从事史。
当初，王廞失败时（王廞兵败失踪，见公元397年记载），和尚昙永藏匿他的幼子王华，让他提着衣裳行李，跟着自己，渡口巡逻士兵对这个小奴仆有些起疑。昙永呵斥王华说：“奴子何不速行！”捶打他数十下，因此没被识破。后来遇上大赦，回到吴郡。因为父亲不知生死，布衣蔬食，不与人交往，也不出来做官，如此十余年。刘裕听说王华贤能，想要任用他，于是为王廞发丧，命王华穿三年丧服。守丧期满，聘用他为徐州主簿。
王镇恶、檀道济进入后秦国境，所向皆捷。后秦将领王苟生献出漆丘，投降王镇恶，徐州刺史姚掌献出项城，投降檀道济，诸屯守都望风款附。唯独新蔡太守董遵坚守不降，檀道济攻拔其城，抓获董遵，斩首。进军攻克许昌，俘虏后秦颍川太守姚垣及大将杨业。沈林子从汴水进入黄河，襄邑人董神虎聚众一千余人来降。太尉刘裕任命他为参军。沈林子与董神虎共攻仓垣，攻克，后秦兖州刺史韦华投降。董神虎擅自回襄邑，沈林子将他处死。
后秦东平公姚绍对后秦主姚泓说：“晋兵已过许昌，安定孤远，难以救援，应该将安定的镇户（姚苌时代强迁到安定的居民，充实军事和农耕人力，称为‘镇户’）迁到长安，充实京畿，可得精兵十万，就算晋、夏交替来侵，我们也不会亡国。不然，晋攻豫州，夏攻安定，我们怎么办？事态已到最后关头，应该立即决断。”左仆射梁喜说：“齐公姚恢（镇守安定）一向有威名，岭北居民都怕他，安定镇户经常与赫连勃勃交战，都有血海深仇，理应守死无二。赫连勃勃终究不能越过安定而远寇我京畿，但是如果我们放弃安定，敌人的战马必定就会出现在郿县。如今，关中之兵足以拒晋，不应该自己预先损削。”姚泓听从。
吏部郎懿横密言于姚泓说：“姚恢在广平之难，有忠勋于陛下（指斩吕超）。自陛下登基之后，并没有特别的赏赐酬答他。如今外则致之于死地，内则不让他参与朝政，安定人自以为孤危，为敌寇所逼，想要南迁的，十家里有九家，如果姚恢拥精兵数万，鼓行而向京师，能不危及社稷吗！应该征召他回朝廷，以慰其心。”姚泓说：“姚恢如果怀有不逞之心，征召他正足以加速其祸。”又不听。
王仲德水军入黄河，逼近滑台。北魏兖州刺史尉建畏懦，率众放弃滑台城，北渡黄河逃走。王仲德进入滑台，宣言说：“晋国本来想以布帛七万匹向北魏借道，没想到北魏守将弃城而去。”北魏主拓跋嗣听闻，派叔孙建、公孙表从河内进军枋头，引兵渡河，斩尉建于城下，投尸于河。呼喊王仲德的士兵，问他们为何入侵北魏。王仲德派司马竺和之回答说：“刘太尉派王征虏从黄河进入洛阳，清扫先帝山陵，并不敢为寇于魏。魏国守将自己放弃滑台离开，王征虏借空城以休息兵马，之后当继续西行，对于晋、魏两国的友好，并没有伤害，你们何必扬旗鸣鼓，耀武扬威呢！”
拓跋嗣又派叔孙建向太尉刘裕诘问，刘裕逊辞答谢说：“洛阳，是晋国旧都，却被羌人占据；晋国很早就想修复先帝山陵。而诸桓氏宗族，司马休之、司马国璠兄弟，鲁宗之父子，都是晋国蠹贼，而羌人又收留他们，以为晋国祸患。如今晋国伐秦，只是想向魏国借一条路，并不敢对魏国不利。”
北魏河内镇将于栗?有勇名，筑垒于黄河河岸，以防备晋军入侵。刘裕写信给他，称呼他为“黑矟（古同“槊”）公麾下”。于栗?好操黑矟，成为他的标识，所以刘裕以此相称。北魏因此拜于栗?为黑矟将军。
19冬，十月十八日，北魏主拓跋嗣进入豺山宫。
20当初，北燕将领库傉官斌投降北魏，既而又叛归北燕。北魏主拓跋嗣派骁骑将军延普渡过濡水，攻击库傉官斌，将他斩首；接着攻打北燕幽州刺史库傉官昌、征北将军库傉官提，都斩首。
21后秦阳城、荥阳二城皆降，晋兵进至成皋。后秦征南将军、陈留公姚洸镇守洛阳，遣使求救于长安。后秦主姚泓派越骑校尉阎生率骑兵三千人前往救援，武卫将军姚益男率步兵一万人助守洛阳，又派并州牧姚懿南屯陕津黄河渡口，为之声援。
宁朔将军赵玄对姚洸说：“如今晋寇益深，人情骇动，众寡不敌，如果出战不捷，则大事去矣。应该集中各处防守的全部兵力，固守金墉，等待朝廷救兵。只要金墉城还在，晋军必定不敢越过我们向西，这样，我军能够不战而坐收其弊。”司马姚禹秘密与檀道济交通，主簿阎恢、杨虔，都是姚禹一党，一起诋毁赵玄，对姚洸说：“殿下以英武之略，接受方面大任；如今婴城固守，向敌人示弱，能不被朝廷责备吗？”姚洸同意，于是派赵玄将兵一千余人向南，据守柏谷坞，广武将军石无讳向东，戍卫巩城。赵玄哭泣着对姚洸说：“赵玄受三帝重恩，所执守的，就是有死而已。但是明公不用忠臣之言，为奸人所误，以后必定后悔。”
既而成皋、虎牢都向晋军降，檀道济等长驱而进，石无讳至石关，仓皇逃回。龙骧司马、荥阳人毛德祖与赵玄战于柏谷坞，赵玄兵败，身上负伤十余处，跌倒在地，大声呼喊。赵玄的司马蹇鉴冒着敌人刀刃，抱着赵玄哭泣，赵玄说：“我已重伤，你快走！”蹇鉴说：“将军如果不行了，我还往哪里去！”两人于是死在一起。
十月二十日，檀道济进逼洛阳。十月二十二日，姚洸出降。檀道济俘虏后秦四千余人，有人建议将俘虏全部活埋，筑成京观（为炫耀武功，聚集敌尸，封土而成的高冢），檀道济说：“安抚平民，讨伐罪人，正在今日！”将俘虏全部释放，遣返回乡。于是夷人、汉人都感怀喜悦，归附的人非常多。阎生、姚益男救兵还没到，听闻洛阳已经陷落，不敢再前进。
己丑（十月无此日），皇帝下诏，派司空、高密王司马恢之前往洛阳，修葺并拜谒皇家陵墓，设置守卫。太尉刘裕任命冠军将军毛修之为河南、河内二郡太守，行司州事，镇守洛阳。
22西秦王乞伏炽磐派秦州刺史王松寿镇守马头，对后秦秦州州府所在地上邽施加压力。
23十一月一日，北魏主拓跋嗣回到平城。
24太尉刘裕派左长史王弘回到建康，提示朝廷，要给他加授九锡。当时刘穆之负责留守政府，而刘裕的旨意从北而来，刘穆之由此愧惧发病。王弘，是王珣的儿子。十二月二十九日，皇帝下诏，任命刘裕为相国、总领百官、扬州牧，封十郡为宋公，备九锡之礼，位在诸侯王上，兼领征西将军、司州、豫州、北徐州、雍州四州刺史如故，刘裕推辞不受。
25西秦王乞伏炽磐遣使晋见太尉刘裕，请求攻击后秦以自效。刘裕拜乞伏炽磐为平西将军、河南公。
姚绍平定姚懿叛乱
26后秦并州牧姚懿的司马孙畅游说姚懿，要他突袭长安，诛杀东平公姚绍，废黜后秦主姚泓，自己取而代之。姚懿认为计划可行，于是将粮食散发，赏赐给河北夷人、汉人，想要树立自己对人民的恩情。左常侍张敞、侍郎左雅进谏说：“殿下是皇上的同母弟弟，居于方面大员的重任，与国家安危相同，休戚与共。如今吴寇内侵，四州倾没，西虏扰边，秦、凉覆败，朝廷之危，有如累卵。粮食，是国家根本，而殿下无缘无故把它散发出去，虚损国家储备，是要做什么呢？”姚懿怒，将二人笞杀。
姚泓接到消息，召东平公姚绍，与之密谋。姚绍说：“姚懿性识鄙浅，容易被人牵着走。此时的主谋，一定是孙畅。陛下即刻派出使者，征召孙畅进京，再派抚军将军姚赞进驻陕城，我去潼关，节度诸军，如果孙畅奉诏而至，我就命姚懿率河东现有部队，一起抵御晋军；如果孙畅不受诏命，便当声明其罪而讨伐。”姚泓说：“叔父之言，社稷之计也。”于是派姚赞及冠军将军司马国璠、建义将军虵玄屯驻陕津，武卫将军姚驴屯驻潼关。
姚懿于是举兵称帝，传檄州郡，又想要将匈奴堡的存粮运到蒲阪供应自己军队。宁东将军姚成都拒绝，姚懿卑辞引诱，又送佩刀为誓，姚成都不从。姚懿派骁骑将军王国率甲士数百人攻打姚成都，姚成都迎击，生擒王国，遣使责备姚懿说：“明公以皇帝至亲身份，身当重任，国危不能救，而更图非分之望；三祖之灵，肯保佑明公吗！我将纠合义兵，到黄河岸上去与你相见！”于是传檄诸城，晓谕以逆顺之义，征兵调粮，以讨姚懿。姚懿也派人去征发诸城军队，但是没人响应他，只有临晋数千户响应姚懿。姚成都引兵渡河，击破临晋叛者。蒲阪居民、安定人郭纯等起兵包围姚懿。东平公姚绍进入蒲阪，抓获姚懿，诛杀孙畅等。
实力胜于计谋
姚绍征召孙畅之计，就是《孙子兵法》中的“上兵伐谋”，上兵伐谋，不是说要用计谋，上兵是用实力，计谋没有什么用。伐谋的意思，是伐掉他的念头，或伐掉他的主谋。姚懿的主谋是孙畅，调走孙畅，他就没主意了。
27这一年，北魏卫将军、安城孝元王叔孙俊去世。北魏主拓跋嗣非常痛惜，对他的妻子桓氏说：“你丈夫活着的时候，你与他同享荣华富贵，如今他死了，你能跟他同受苦难吗？”桓氏于是自缢，死后被安排与丈夫合葬。
28北魏境内丁零部落酋长翟猛雀起兵反叛，裹挟吏民，进入白涧山为乱。北魏内都大官、河内人张蒲，会同冀州刺史长孙道生率军讨伐。长孙道生，是长孙嵩的侄儿。长孙道生想要进兵攻击翟猛雀，张蒲说：“吏民并非乐于为乱，是被翟猛雀所胁迫。如今不加分别，一起攻击，其中想要反正的，也没有途径，必定与他同心协力，据险以拒官军，那就不易平定了。不如先遣使晓谕，宣传我们的政策，凡是不与翟猛雀同谋者，都不连坐，他们必定欢喜而离散了。”长孙道生听从，于是投降的有数千家，让他们恢复旧业。翟猛雀与其党羽一百余人出走，张蒲等追击，将翟猛雀斩首，左部尚书周几穷讨余党，全部诛杀。