4月24日，在《警钟日报》上发表词《水调歌头·书王船山先生龙舟会杂剧后》，署名光汉。
4月25日，在《警钟日报》上发表词《壶中天慢·春夜望日［月］》，署名光汉；又刊于1905年6月23日出版的《国粹学报》第5期，文字有所改动，题目改为《元宵望月》，署名刘光汉。《遗书》据《国粹学报》所刊收入《左盦词录》。
4月25、26日，在《警钟日报》上连载《论白话报与中国前途之关系》，未署名，但文中提到的本人旧作《小学释例》、《小学发微》均系其作品，可见该文为其所作。
4月30日，在《中国白话报》第10期上发表《论中国地理的形势》、《军国民的教育》，署名光汉；同期和第13期（6月23日）、第14期（7月3日）连载《孔子传》，署名光汉。
5、6月间，回扬州探亲，携未婚妻何班（字志剑）返上海，何班进爱国女校就读，改名震（也作“振”），并为显示争取男女平等起见，将姓氏也改为从父母两姓，自署何（殷）震。两人6月结婚。（据《警钟日报》1904年7月26日何震《赠侯官林宗素女士》诗，林宗素“附识”说，“何女士为刘申叔先生夫人，结婚才逾月……”，则刘何结婚当在6月。）
何震亦是仪征人，生于1887年，[46]其父何承霖曾中过举人，任常州武进县学教谕。刘何两家一向有交情，何承霖的长子何家辂曾娶刘师培之叔刘富曾的女儿为妻。
5月4、5日，在《警钟日报》上发表《论孔教与中国政治无涉》，未署名。考其《甲辰年自述诗》中有自注“著《孔教与中国政治无涉论》”，故知此文乃其作品；《东方杂志》本年第3期和《萃新报》本年第4期转录；收入《遗书》之《左盦外集》卷九。
5月11、12日，在《警钟日报》上发表《论中国阶级制度》，篇末署名申；《东方杂志》本年第6期转录。
5月13日，在《警钟日报》上发表一诗，题《三月十九日俗传太阳生辰，乃明怀宗殉国之日，而中国亡国之一大纪念也，作诗一章》，署名光汉。
5月29日，在《中国白话报》第12期上刊《板**集诗余》，署名光汉辑。
6月3、4日，在《警钟日报》上发表《教育普及议》，未署名。在其《甲辰年自述诗》中有自注“余著《教育普及议》”，于此可知该文为其作品；《东方杂志》本年第4期转录。
6月22日至25日，在《警钟日报》上连载《论中国并不保存国粹》，未署名。考其《甲辰年自述诗》中有自注“曾作《中国并不保存国粹论》”，故知此文乃其作品；收入《遗书》之《左盦外集》卷十四。
7月3日，在《中国白话报》第14期上发表《宗教》（“历史”第八章）、《论山脉（中干）》和《讲教授国文的法子》，署名光汉。
7月12日，在《中国白话报》第15期上发表《教育》（“历史”第九章）、《论山脉（南干）》和《讲民族（警语录之四）》，署名光汉。
7月15日至20日，在《警钟日报》上连载《思祖国篇》，未署名。其在《甲辰年自述诗》自注中曾说“余作《思祖国篇》”，钱玄同在《遗书》之《左盦外集》目录后记中也提到该文为其在上海时所作。[47]
7月20日，在《警钟日报》上发表诗《杂咏》，署名光汉人。
7月22日，在《中国白话报》第16期上发表《讲地理的大略》，署名光汉；同期和第17期（8月1日）、第19期（8月20日）连载《中国革命家陈涉传》，署名光汉。
夏，撰《陈去病清秘史序》，署名光汉子。收入《遗书》之《左盦外集》卷十七。
8月1日，在《中国白话报》第17期上发表《泰州学派开创家王心斋先生学术》，署名光汉；同期上还有诗《板**集》，署名光汉辑。
8月2日，在《警钟日报》上发表《新史篇》，署名无畏。与《陈去病清秘史序》系同文，仅个别字句有异。
8月10日，在《中国白话报》第18期上发表《中国思想大家陆子静先生学说》，署名光汉。
8月11日，在《政艺通报》甲辰第12号上发表《变夏篇》，署名仪征刘光汉，即《攘书》中之《变夏篇》。
8月18日，在《警钟日报》上发表诗《题佩忍与林宗素孙济扶女士论文绝句后》，署名申叔。
8月20日，在《中国白话报》第19期上发表《中国历史大略》，署名光汉。
8月30日，在《中国白话报》第20期刊诗《民劳集》，署名光汉辑；在同期和第21至24期合刊（10月8日）上连载《中国排外大英雄郑成功传》，署名光汉。
本月，在《觉民》第9、10期合本上发表诗《杂咏》，署名申叔。
9月7、8、10、11、12日，在《警钟日报》上连载《甲辰年自述诗》，署名光汉。全诗长达三百余句，间有自注，述本人生平、思想和作品。
9月15日，在《警钟日报》上发表诗《题陈右铭先生西江墨沈》，署名光汉。
9月16、17日，在《警钟日报》上发表诗《明代扬州三贤咏》，署名光汉，所咏三贤为“江都曾襄闵公铣”、“泰州王心斋先生艮”、“宝应刘练江先生永澄”。
9月19日，在《警钟日报》上发表诗《春深》和《吊何梅士》，署名光汉。
10月8日，在《中国白话报》第21至24期合刊上发表《论列强在中国的势力》、《上古期》、《攘夷实行家曾襄闵公传》（未完）、《西汉大儒董仲舒先生学术》、《说立志（警语录之三）》，署名光汉。
10月24日，在《警钟日报》上发表诗《岁暮怀人》，署名光汉，共9首，每首诗末注明所怀之人，分别为：余杭章太炎、山阴蔡孑民、庐江吴彦复、桂林马君武、吴江陈佩忍、侯官林少泉、潼川谢无量、沧州张溥泉、甘泉朱菊平。
10月29日，在《警钟日报》上发表诗《黄炉歌呈彦复穗卿》，署名光汉。
10月30日，在《警钟日报》上发表诗《题照相片》，署名光汉；收入《遗书》之《左盦诗录》卷一《匪风集》。在同日的《警钟日报》上还发表文《原戏》，署名光汉。钱玄同把《原戏》系于民元前五年（1907年），依据该文发表于1907年10月26日出版的《国粹学报》第34期，赵万里《刘申叔先生著述目录》（《北平图书馆月刊》第1卷第6号）同于钱玄同系年。实则该文先发表于《警钟日报》，《国粹学报》上所发者只是在文字上稍稍有所更动而已。收入《遗书》之《左盦外集》卷十三，即《国粹学报》所发者。
11月19日，与林獬、万福华谋刺有亲俄言行的前广西巡抚王之春。
行刺前，刘师培将张继所赠之手枪借给万福华。万在上海金谷香西菜馆动手行刺。因万不精于射击，刺杀未成，反而被捕。随后黄兴、张继、苏鹏、陈天华等十余人被牵连入狱。刘则与林獬、蔡元培、杨笃生等在外奔走营救。不久除万福华外，余人全数开释，万以扰乱租界治安罪监禁十年。
11月21日至12月3日，在《警钟日报》上连载《论小学与社会学之关系》，未署名。其在《周末学术史序》等文中多次提及“旧作《小学与社会学之关系》”，足见该文为其作品。钱玄同在将该文收入《遗书》《左盦外集》卷六时所作之案语称：“此篇曾登入民元前八年甲辰之《警钟日报》，余当时剪存，今收入外集。《警钟日报》所刊者，误字满纸，不能卒读。兹寻绎数过，改正若干字……至此篇是否已完，亦无从知悉。原文无子目，余今为加之，以期醒目。”[49]全文主旨在于以社会学考中国造字之原，共33则，所考之字有舅、姑、妇、赋、君、林、烝、田、尊、酋、社、牧、赀、民等。
秋冬之际，先后参加军国民教育会、暗杀团、光复会。[50]